Qui d'entre vous utilise le format de data HDF5 sous mageia?
Je m'y perds un peu dans toutes les librairies.
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nic80 Membre non connecté
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Reprise du message précédent
Bonjour,jhdf5 et jhdf également, mais bon bien que présents dans /usr/lib/java, ils ne semblent pas être trouvés.
Anonymous23 Membre non connecté
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Normalement j'ai coché ces paquets.
Par contre je sais que ce programme est compilé avec open-jdk 15 en standard.
J'ai essayé de mettre le 16 en cochant java-latest-openjdk mais le pc n'a pas encore fait la transition.
Ai je une variable à changer, est ce dangereux pour le système?
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Le changement de java ne sert à rien me si j'ai trouvé comment l'activer!
Édité par Anonymous23 Le 28/05/2022 à 14h50
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Je dois lui rentrer plusieurs chemins ou chercher les fichiers et j'ai mis
hdf.lib.dir = /usr/lib64
hdf5.lib.dir = /usr/lib64
hdf5.plugin.dir = usr/lib64/plugin
En effet certains des fichiers sont dans /usr/lib64.
Mais il semble que hdf5.jar et hdf.jar soient dans /usr/lib/java.
Se pourrait il qu'il y ait un mauvais partage entre lib et lib64?
Est ce qu'on peut rentrer plusieurs chemins dans son fichier build.properties?
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J'ai trouvé un post sur le forum du HDF group qui parle de ce bug mais sans réponse valable.
J'ai donc déterré le sujet.
https://forum.hdfgroup.org/t/jarhdf5-not-found/9813
Bonne soirée
Édité par Anonymous23 Le 28/05/2022 à 19h26
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Une erreur sur deux a disparue, celle en jarhdf5
nic80 Membre non connecté
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Visiblement, on cherche un jarhdf5.jar et un jarhdf.jar qui n' existent pas.
Donc, on pourrait essayer de :
- "ln -s /usr/lib/java/jhdf5.jar /lib64/jarhdf5.jar "
- "ln -s /usr/lib/java/jhdf.jar /lib64/jarhdf.jar "
Cependant je doute que ça règle les problème de symbols non trouvés par la suite... La version 3.2.0 n' est de toute façon pas compilable avec la version de hdf présente dans Mageia 8 ( les symboles H50token n' y existent tout simplement pas apparement ( apparition dans hdf5-1.12)).
edit: après la compilation de hdf5, un fichier jarhdf5.jar a été crée ?
Édité par nic80 Le 28/05/2022 à 20h20
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Il est dans usr/local/lib .En installant hdf4 cela a produit le même résultat avec jarhdf.
J'ai maintenant une nouvelle erreur
Édité par Anonymous23 Le 28/05/2022 à 21h03
nic80 Membre non connecté
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Je pense que oui.
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Mais il ne faut pas être optimiste. Il est retiré parce que non instalable :/
Anonymous23 Membre non connecté
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J'ai corrigé le tir.
hdfview 3.2.0 avec hdf5 1.12.0
Erreur suivante:
Je vais regarder sur le net ce que je trouve
@+
Anonymous23 Membre non connecté
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J'ai posté un nouveau post sur le forum du HDF group:
https://forum.hdfgroup.org/t/hdfview-build-error-on-linux/9816
Bonne journée
Anonymous23 Membre non connecté
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Si je fais java -version je le vois correctement.
Est ce qu'il y a ou non une variable d’environnement à changer?
Je présume que non?
Édité par Anonymous23 Le 29/05/2022 à 11h03
Anonymous23 Membre non connecté
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Au format .mat (matlab files) 271 kB
Au format HdF5: 23MB
Au format txt formatté json 107 MB.
Du coup effectivement le goulot d'étranglement du flux de données imaginé par Yuusha peut devenir une réalité suivant la manière dont je sauvegarde et ouvre ensuite.
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